Олексій Трохимович Пухлій народився в селі Лебедин (нині Шполянський район, Черкаська область) у православній родині селян-власників. Батько - Трохим Максимович Пухлій. Мати - Мар'яна Максимівна.
Олексій Трохимович Пухлій одружився на Устині (рел. Иустинии) Григорівні. Разом вони мали пятеро дітей:
18 жовтня 1887 року дочка Єлисавета Олексіївна Пухлій (19 років) вийшла заміж за Яківа Єфимовича Кочергу (21 рік). Обоє першим шлюбом.
Після смерті Устини Григорівни, Олексій Трохимович Пухлій одружився вдруге - на Килині (рел. Акилині) Прохірівні. Разом мали четверо дітей:
Після смерті Олексія Трохимовича Пухлія, Килина вийшла заміж за вдовця Василя Сидоровича Олійника (66 років) - мешканця села Турія, 3 червня 1916 року. Свідком (рел. поручителем) Килини Прохірівни на церемонії одруження був її прийомний син, Семен Олексійович Пухлій.